屯溪名源于水名，“屯”字据《广雅》解释为“聚也”，诸溪聚合，谓之屯溪。《禹贡》划中国为九州，屯溪一地，属扬州之南境。秦汉时，皆为歙州之西地，屯溪起源于三国。古时，歙州一带多处荒蛮，这里居住着一群山民，又称山越，较有名的首领，东有(今歙县)金奇，北有(今黟县)陈仆，而驻安勒山(今屯溪华山)有毛甘。各有山民一至二万户，结族而居，过着日出而作、日入而息的耕种渔牧生活。他们割据称雄，不纳王租，并抗孙吴政权，使吴军不敢入。为此，孙权派威武中郎将贺齐前来讨伐，曾屯兵于此。贺齐王平定山越，班师回朝，受到孙权出宫迎接、设宴庆贺，遂下令将贺齐在此屯兵之处，“屯兵于溪，故曰屯溪”，遂命名屯溪。
1949年4月30日屯溪和平解放，同年5月13日，中共皖南区党委通知，设徽州专区（治所初在歙县，不久迁往屯溪），属皖南行署（行署初设屯溪，后迁芜湖），改屯溪镇为屯溪市（屯溪原为休宁县一镇），属徽州专区，全区领屯溪市和休宁、祁门、绩溪、旌德、歙、黟六县；1952年2月4日徽州专区共领一市（屯溪）九县（休宁、歙县、祁门、黟县、绩溪、旌德、太平、石台、宁国）。同年4月12日．废行署区，徽州专区属安徽省。1953年12月1日，屯溪直隶安徽省，徽州专区领九县，1955年屯溪降为地辖市。1956年1月12日，撤销徽州专区，复升屯溪为省辖市。5月16日，将屯溪交由休宁县领导。1960年12月13日改屯溪市为休宁县辖镇。1961年4月13日，重设徽州专区，8月16日，又改屯溪为地辖市；12月15日，复置黟县，徽州专区领一市八县，1963年5月20日屯溪降为休宁县属镇。1968年7月7日，成立徽州地区革命委员会，属县不变。1971年3月29日，改徽州专区为徽州地区。1975年12月19日，复升屯溪为地辖市（县级）。1979年2月27日，改徽州地区革命委员会为徽州地区行政公署。徽州地区领八县一市，即：歙县、祁门、休宁县、黟县、绩溪、旌德、太平县、石台和屯溪市。1983年12月1日，经国务院批准，撤销太平县，设立县级黄山市，以原太平县、歙县的黄山公社、石台县的广阳公社的行政区域和黄山管理局现有辖区为其行政区域，由省直辖。1987年11月27日，经国务院批准改徽州地区为地级黄山市（俗称大黄山市），设立黄山市屯溪区。
